Digitalni mikroskopi uglavnom imaju sljedeće prednosti:
1. Ima funkciju mikroskopske kamere, koja čuva uočene mikroskopske efekte i formira grafičke datoteke, koje se mogu proslijediti relevantnim odjeljenjima; optički mikroskop se može posmatrati samo kroz okular i ne može se koristiti za mikroskopsku fotografiju.
2. Povezani na različite uređaje za prikaz kao što su kompjuter/tablet/mobilni telefon/TV/ekran, više ljudi može promatrati u isto vrijeme; optički mikroskop može posmatrati samo jedna osoba.
3. Kroz pregled ekrana, umor očiju se može smanjiti; optičke mikroskope je potrebno stalno promatrati kroz okular, što lako može uzrokovati pretjerani zamor očiju.
4. Uređaj za snimanje digitalnog mikroskopa može imati funkcije mjerenja, štampanja grafičkih izvještaja, video snimanja itd.; optički mikroskop može vršiti samo mikroskopsko posmatranje.
5. Digitalni mikroskop je nova era u razvoju savremenih naučnih instrumenata i ima mnogo funkcija koje optički mikroskopi nemaju.
Digitalni mikroskopi su pogodni za širok spektar konvencionalnih optičkih mikroskopa. Konvencionalni optički mikroskopi mogu se pretvoriti u digitalne mikroskope ugradnjom digitalne kamere (tj. elektronskog okulara). Jednostavan je za rukovanje, intuitivan i ima visoku efikasnost verifikacije. Pogodan je za inspekciju elektronskih industrijskih proizvodnih linija, verifikaciju štampanih ploča, verifikaciju nedostataka lemljenja (neusklađenost štampe, savijanje, itd.) u komponentama štampanog kola, verifikaciju računara sa jednom -pločom, Vakuumski fluorescentni displej VFD verifikacija, itd., povećava stvarnu sliku i prikazuje je na ekranu računara, a može da sačuva, uveća i odštampa sliku. Može se izmjeriti mjernim softverom.
