Mikroskopi omogućavaju naučnicima da posmatraju i proučavaju objekte koje ljudsko oko ne može otkriti. Dvije metode promatranja mikroorganizama su svjetlosna mikroskopija i elektronska mikroskopija. Optička mikroskopija koristi vidljivu svjetlost za otkrivanje mikroorganizama. Ovo je donekle nepovoljno jer elektronski mikroskopi zahtijevaju vakuum za ispitivanje uzoraka. Prijenosni i pristupačni, svjetlosni mikroskopi omogućavaju istraživačima da promatraju žive organizme. Ali optički mikroskopi imaju i svoje nedostatke.
uvećati
Uvećanje optičkog mikroskopa je oko 2000 puta i ne može se povećati kao elektronski mikroskop. Relativno duge talasne dužine svetlosti smanjuju snagu uvećanja optičkog mikroskopa jer su za fokusiranje i širenje svetlosti potrebna mala sferna sočiva.
Rezolucija
Optički mikroskopi imaju nižu rezoluciju. Kako se prelomljeni svjetlosni valovi šire, rezultirajuća slika je zamućena. Čak i instrumenti koji obezbeđuju dodatna sočiva za povećanje uvećanja čine malo da poboljšaju rezoluciju slike.
posmatrajte unutrašnju strukturu
Teško je posmatrati unutrašnju strukturu živih bića bez upotrebe boja. Živi uzorci moraju biti ubijeni i fiksirani tokom bojenja, eliminirajući uobičajene prednosti svjetlosne mikroskopije.





